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龟缸养水草有难度，主要因为乌龟会破坏水草（啃食、踩踏），且频繁换水不利于水草扎根。虽然水草能净化水质，但选择耐水植物如龙眼叶或水蕨、水榕等作为替代，可能更实用，兼顾美观和生态。
草龟缸长绿藻很常见。主要解决方法有：严格控光，每天光照不超过8小时，用定时器控制；物理清理，每周刷洗缸壁，换水时用虹吸吸走底部的藻类和腐烂碎屑，及时清洗过滤棉；管理水质，每周换水1/3，保持硝酸盐低于20ppm，可种植水榕等水草竞争养分；引入天敌如苹果螺、黑壳虾（注意兼容性）；适当加大过滤水流。化学除藻剂风险大，应谨慎使用。综合管理才能有效控制绿藻。
