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巴西龟对干净水质要求高，不洁水影响健康，甚至导致眼睛问题。保持水质清洁关键方法有：喂食后及时换掉脏水并清洁容器；建立水族箱氮循环，定期检查氨、亚硝酸盐等指标，必要时增加换水；使用有效的过滤器帮助分解废物。这些措施能让巴西龟健康成长。
小鳄龟、蛋龟和草龟对水质要求不高。小鳄龟原产地环境复杂，适应性强，家庭饲养可用静置除氯的自来水，每周换水1-2次。蛋龟同样适应性强，可用除氯自来水，水温保持在25-30℃，每1-2周换水一次。草龟是我国本土龟种，适应多变水质，也用除氯自来水，可放水生植物净化水质，每周换水1-2次。
